换一批贵州地方猪脂肪特异蛋白27基因SNPs筛查与生物信息学分析
SNPs Screening and Bioinformatics Analysis of Fsp27 Gene in the Breeds of Guizhou Local Pigs
摘要以3个贵州地方猪种(可乐猪、贵州白香猪、黔北黑猪)为试验素材构建品种DNA池,采用直接测序技术对猪脂肪特异蛋白27(fat-specific protein 27,Fsp27)基因的第4～5外显子区域进行SNPs快速筛查.共检测出4个SNPs位点:intron3-T2169C,exon4-G5A,intron4-G21C和exon5-C5G,其中exon4-G5A和exon5-C5G使编码氨基酸发生Arg→Gln,Thr→Ser的改变.进一步的生物信息学分析显示,exon4-G5A位点的变异导致mRNA的二级结构改变,exon5-C5G多态位点使蛋白质的二级结构发生变化,且当exon4-G5A和exon5-C5G位点的碱基分别为A和G时蛋白质三级结构与其它3种碱基组合(G与G,G与C,A与C)的三级结构明显不同.
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DOI
10.3969/j.issn.1671-7236.2012.07.020
发布时间
2012-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
贵州省农业科技攻关项目（(黔科合NY字(2009)3073)）
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