换一批猪流感病毒H1N1亚型天津分离株核蛋白、基质蛋白、非结构蛋白基因克隆与序列分析
Cloning and Sequence Analysis of Nucleoprotein, Matrix Protein and Nonstructural Protein Gene of H1N1 Subtype Swine Influenza Virus Isolated from Tianjin
摘要从天津地区不同猪场分离到6株H1N1亚型猪源流感病毒(SIV).根据GenBank发表的H1N1亚型SIV的核蛋白(NP)、基质蛋白(M)及非结构蛋白(NS)基因序列,分别设计3对引物,将RT-PCR产物克隆至pMD18-T载体,进行测序分析.遗传进化分析结果表明:A/swine/Tianjin/TJ2/2005(H1N1)与A/swine/Tianjin/TJ4/2006(H1N1)的NP、M及NS基因核苷酸序列在遗传进化树中均与A/swine/Guangdong/33/2006(H1N1)位于同一分支上,属于古典型H1N1猪谱系;A/swine/Tianjin/TJ3/2006 (H1 N1)与A/swine/Tianjin/TJ8/2006(H1N1)的NP、M及NS基因核苷酸在遗传进化树中均与A/Dunedin/2/2000(H1N1)组成一个大分支,可能起源于人谱系;A/swine/Tianjin/TJ6/2009(H1N1)与A/swine/ Tianjin/ TJ7/2009(H1N1)NP、M及NS基因核苷酸序列在遗传进化树中均与A/swine/Jiangsu/s15/2011(H1N1)位于同一分支上,属于类禽H1N1猪谱系.本试验对6株H1N1亚型SIV的NP、M及NS全基因序列进行分析,在一定程度上揭示了天津地区H1N1亚型SIV的基因进化与流行情况.
更多相关知识
关键词
猪流感H1N1亚型核蛋白基因基质蛋白基因非结构蛋白基因序列分析swine influenzaH1N1 subtypenucleoprotein genematrix protein genenonstructural protein genesequence analysis
分类号
S852.65
栏目名称
发布时间
2016-05-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
天津市科技计划（10ZCZDNC02800）；
天津市应用基础及前沿技术研究计划（12JCYBJC20100）
- 浏览1
- 被引1
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
