换一批禽呼肠孤病毒σB和σC蛋白二级结构及其细胞抗原表位预测
Prediction of Secondary Structure and B-and T-cell Epitopes of σB and σC Proteins of Avian Reovirus
摘要研究旨在运用DNAStar生物软件及Garnier-Robson、Chou-Fasman等方法分析禽呼肠孤病毒(avian reovirus,ARV)标准毒株S1133 重要结构蛋白σB和σC的二级结构及其T细胞和B细胞抗原表位.通过分析其亲水性、柔韧性、表面可及性和抗原指数等特性,对σB和σC蛋白的B细胞抗原表位进行预测;以Rothbard-Taylor和AMPHI方法预测σB和σC蛋白的T细胞抗原表位.结果显示,σB和σC蛋白形成α-螺旋结构的能力较差,但与σB蛋白相比,σC蛋白含有较多的β-折叠结构、转角及无规则卷曲等二级结构,因而σC蛋白二级结构较复杂.分析结果还表明σB和σC蛋白均含有潜在B细胞和T细胞抗原表位,尤其是σC蛋白具有较多的B细胞和T细胞抗原表位.本试验为深入研究σB和σC蛋白的免疫学特性及研发ARV新型疫苗和药物靶标奠定基础.
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分类号
S852.65
栏目名称
DOI
10.16431/j.cnki.1671-7236.2016.11.011
发布时间
2017-01-08
基金项目
广西自然科学基金（2014GXNSFCA118006）；
广西水产畜牧兽医局科技项目（桂渔牧科201452003）
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