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水貂PRLR基因的克隆及生物信息学分析

Cloning and Bioinformatics Analysis of Prolactin Receptor Gene of Mink

摘要本研究旨在从水貂卵巢组织中克隆催乳素受体(prolactin receptor,PRLR)基因编码区全长序列,并进行生物学信息分析,为研究其结构和功能奠定基础.根据GenBank中登录的犬PRLR基因的mRNA预测序列(登录号:XM_025436332.1)设计1对引物,采集性成熟的健康水貂卵巢组织样本,提取RNA并反转录合成cDNA,以cDNA为模板PCR扩增PRLR基因,将其插入pEASY-Blunt Simple Vector中,筛选阳性克隆测序后进行生物信息学分析.结果显示,水貂PRLR基因编码区序列全长为1878 bp,编码了625个氨基酸,水貂PRLR基因核苷酸序列与海獭同源性最高,为97.7%.系统进化树分析也显示其和海獭亲缘关系最近.对水貂卵巢PRLR基因编码蛋白进行生物信息学分析表明,PRL R蛋白含有1个信号肽,1个细胞外区域,1个跨膜区和1个膜内区;水貂PRLR蛋白为单次跨膜蛋白,其N端的D1部分含有2对保守的二硫键(Cys36—Cys46和Cys75—Cys86),D2部分含有保守的WS-基序(WS-E-WS).水貂PRLR蛋白具有和其他PRLR蛋白相似的膜外和膜内结构.本试验结果为进一步研究和揭示水貂PRL R蛋白的结构及功能奠定了基础.

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DOI 10.16431/j.cnki.1671-7236.2019.02.003
发布时间 2019-04-18(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
国家自然科学基金(31772606) 吉林省国际科技合作项目(20170414049GH) 创新工程项目(CAAS-ASTIP-2018-ISAPS)
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中国畜牧兽医

中国畜牧兽医

2019年46卷2期

345-353页

ISTICPKUCSCD

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