高温胁迫下罗非鱼源无乳链球菌的比较转录组分析

Comparative Transcriptome Analysis of Streptococcus agalactiae from Tilapia Under High Temperature Stress

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摘要[目的]从分子水平了解高温季节罗非鱼无乳链球菌病容易暴发的原因.[方法]在35和28 ℃分别培养无乳链球菌,提取总RNA并进行转录组测序;利用华大基因Dr.Tom自主分析平台进行差异表达基因分析,并针对差异基因进行了 KEGG通路和GO功能的分类和富集;通过实时荧光定量PCR随机检测10个基因的差异表达,确定转录组数据的可靠性.[结果]共得到35和28 ℃培养条件下的显著性差异表达基因357个,其中上调基因229个,下调基因128个;GO数据库富集能得到多个具有显著性的功能集,多集中在碳源代谢相关的途径,包括碳水化合物分解代谢过程(carbohydrate catabolic process)、糖原代谢过程(glycogen metabolic process)、细胞葡聚糖代谢过程(cellular glucan metabolic process)等;差异基因中发现了多个与无乳链球菌致病性相关的基因,如烷基过氧化氢还原酶亚基、cAMP因子、C5a肽酶等编码基因;实时荧光定量PCR与转录组数据间皮尔逊相关系数R值为0.979(P＜0.001),说明转录组数据可靠有效.[结论]高温能够显著影响无乳链球菌碳源代谢相关的途径,可能通过加快菌体利用碳源而促进菌体的生长和扩散.高温也诱导了多个与致病性相关的基因出现上调表达,其中cAMP因子引起的细胞膜溶解和氧化还原酶类引起的免疫逃避可能是高温下无乳链球菌致病性增强的主要因素.