摘要[目的]本研究旨在通过研究1株牦牛源产细菌素屎肠球菌SWUN5732的基因组序列,发掘该菌种的关键功能性特征基因.[方法]通过Illumina PE150测序系统,对屎肠球菌SWUN5732进行基因组测序,并在GO、KEGG、COG和NR数据库对基因组的基本功能特征进行注释,结合NR数据库的注释,挖掘出基因组中潜在的抗菌、抗氧化和抑菌肽相关基因.[结果]屎肠球菌SWUN5732的基因组大小为2 824 168 bp,有效平均GC含量约为38.09％;可检测到的编码基因数量约为2 919个,全部编码基因总长度约为2 387 787 bp,平均长度约为818 bp.在GO数据库中SWUN5732基因组一共有8 851个基因得到注释,分别注释到分子功能、细胞组分和生物过程三大类45个条目;在KEGG数据库中SWUN5732基因组共有1 534个基因被注释,分别为细胞过程、环境信息处理、遗传信息处理、人类疾病、新陈代谢和生物体系统6大功能38个通路;在COG数据库中,SWUN5732基因组共有2 118个基因被注释,在基因组中还包含4个有ABC型氨基酸转运系统(渗透酶组分)的功能序列和具有重复ATP酶结构域的ABC转运蛋白的序列;通过NR数据库对屎肠球菌SWUN5732的功能注释,一共有2 844个基因得到注释,发现SWUN5732基因组中包含抗菌物质、抗氧化物质和抑菌肽类相关基因.系统进化树分析结果表明,该菌株与ATCC 19434的进化关系最为接近.[结论]本研究完成对牦牛源产细菌素屎肠球菌SWUN5732基因组测序和潜在抑菌物质挖掘,证实该菌株具有耐酸耐胆盐环境适应性并探究了抗氧化、免疫调控、产细菌素和抗菌物质相关基因,为此菌株作为抗生素替代品或饲料益生菌添加剂提供了可靠的依据.