基于免疫信息学技术的雏沙门菌多表位疫苗构建
Construction of a Multi-epitope Vaccine Against Salmonella Pullorum by Immunoinformatics Approach
摘要[目的]设计针对雏沙门菌(Salmonella Pullorum)IpaJ蛋白的多表位疫苗(multi-epitope vaccine,MEV),为净化鸡白痢提供新的疫苗.[方法]选用IEDB预测雏沙门菌IpaJ蛋白的T淋巴细胞主要组织相容性复合体Ⅰ(MHCⅠ)类分子结合表位;用NetMHCⅡpan 4.0 Server预测T淋巴细胞MHC Ⅱ类分子结合表位;用IEDB预测B淋巴细胞表位.将各个服务器预测结果筛选出的表位经过VaxiJen v 2.0评估抗原性后,将合格的表位通过柔性linker串联成多表位疫苗.对构建的多表位疫苗进行抗原性、理化性质、N-糖基化位点、二级结构和三级结构预测.使用分子对接评估多表位疫苗与免疫受体的结合能力,使用免疫模拟评估多表位疫苗的免疫效果,最后优化密码子便于克隆表达.[结果]经筛选后,选择4个MHC Ⅰ、4个MHC Ⅱ和8个B淋巴细胞表位优势表位构建的多表位疫苗MEV-IpaJ.多表位疫苗MEV-IpaJ的分子质量为28.18 ku,为稳定亲水蛋白,具有良好的抗原性,存在4个潜在的N-糖基化位点,a-螺旋、延长链、β-转角和无规则卷曲分别占20.38%、19.23%、8.08%和52.31%.三级结构Ramachandran作图显示,优势区域中含有残基数占89.9%%,进行细化后优势区域的残基数增加到94.0%,三级结构突出表位作图也证明MEV-IpaJ具有良好的免疫原性.分子对接结果显示,MEV-IpaJ与Toll样受体2(Toll-like receptor 2,TLR2)和TLR4蛋白分子可对接.免疫模拟结果显示,MEV-IpaJ具有较好的免疫应答,能提高部分细胞因子的表达,经密码子优化确保设计的MEV-IpaJ可在大肠杆菌K12表达系统中高效、稳定地表达.[结论]本研究构建的多表位疫苗MEV-IpaJ可有效表达并可能诱导强烈的T细胞和B细胞免疫应答.本研究为雏沙门菌多表位疫苗的设计提供了一种新的方法,为雏沙门菌多表位疫苗的研发提供了理论依据及数据支持.
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