• 医学文献
  • 知识库
  • 评价分析
  • 全部
  • 中外期刊
  • 学位
  • 会议
  • 专利
  • 成果
  • 标准
  • 法规
  • 临床诊疗知识库
  • 中医药知识库
  • 机构
  • 作者
热搜词:
换一批
论文 期刊
取消
高级检索

检索历史 清除

医学文献>>
  • 全部
  • 中外期刊
  • 学位
  • 会议
  • 专利
  • 成果
  • 标准
  • 法规
知识库 >>
  • 临床诊疗知识库
  • 中医药知识库
评价分析 >>
  • 机构
  • 作者
热搜词:
换一批

鸡DCAF1生物信息学分析及对J亚群禽白血病病毒复制的影响

Bioinformatic Analysis of Chicken DCAF1 and Its Impact on the Replication of ALV-J

摘要[目的]为分析鸡损伤特异性DNA结合蛋白和泛素连接酶复合物骨架蛋白库林4相关因子1(DDB1 and CUL4 associated factor 1,DCAF1)蛋白的生物学特性,构建DCAF1基因的真核表达载体,并初步探究其对J亚型禽白血病病毒(ALV-J)复制的影响.[方法]在NCBI中下载相关物种DCAF1蛋白氨基酸序列,采用Mega 11.0软件构建系统进化树;利用ProtParam、ProtScale、TMHMM等在线程序分析鸡DCAF1蛋白的氨基酸序列,预测其理化性质、保守结构域及二、三级结构和互作蛋白等生物信息;构建鸡DCAF1基因重组真核表达载体,通过实时荧光定量PCR和Western blotting技术检测ALV-J感染对DCAF1 mRNA和ALV-J Env蛋白表达水平的影响及过表达DCAF1对ALV-J复制的影响.[结果]鸡DCAF1蛋白由1 496个氨基酸组成,其分子质量约为170 ku;系统进化树结果表明,鸡与红鸭亲缘关系最近,与斑马鱼亲缘关系最远.生物信息学预测结果表明,鸡DCAF1蛋白无跨膜结构域,无信号肽表达,包含ARM折叠、LisH和WD40重复3个主要结构域与末尾1个酸性结构域,其互作蛋白为DDB1、CUL4A、SAMHD1等.鸡DCAF1蛋白二级结构主要由无规则卷曲和α-螺旋组成,分别占比44.85%和41.18%,延伸链和β-折叠占比次之,分别是9.76%和4.21%.三级结构与二级结构基本一致,建模一致性为93.79%.ALV-J感染24、48 h后,DCAF1基因和蛋白表达水平均极显著高于感染0 h时(P<0.01);过表达DCAF1后,与感染对照组相比,ALV-J Env蛋白显著升高(P<0.05).[结论]鸡DCAF1蛋白由1 496个氨基酸组成,分子质量约170 ku,属于稳定的亲水蛋白,不含跨膜结构域.本研究成功构建了 DCAF1基因真核表达载体.在ALV-J感染的细胞中,DCAF1蛋白和基因表达水平极显著升高,而过表达DCAF1则显著促进ALV-J复制.研究结果为进一步阐明鸡DCAF1的生物学功能及其与ALV-J互作的分子机制奠定了基础.

更多
广告
分类号 S831
栏目名称 生物技术
DOI 10.16431/j.cnki.1671-7236.2024.05.005
发布时间 2024-05-29
基金项目
国家自然科学基金 国家肉鸡产业技术体系项目
  • 浏览4
  • 下载0
中国畜牧兽医

加载中!

相似文献

  • 中文期刊
  • 外文期刊
  • 学位论文
  • 会议论文

加载中!

加载中!

加载中!

加载中!

特别提示:本网站仅提供医学学术资源服务,不销售任何药品和器械,有关药品和器械的销售信息,请查阅其他网站。

  • 客服热线:4000-115-888 转3 (周一至周五:8:00至17:00)

  • |
  • 客服邮箱:yiyao@wanfangdata.com.cn

  • 违法和不良信息举报电话:4000-115-888,举报邮箱:problem@wanfangdata.com.cn,举报专区

官方微信
万方医学小程序
new翻译 充值 订阅 收藏 移动端

官方微信

万方医学小程序

使用
帮助
Alternate Text
调查问卷