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基于CRISPR/Cas12a-RT-RAA的猪繁殖与呼吸综合征病毒快速检测方法的建立

Establishment of a Rapid Detection Method for Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus Based on CRISPR/Cas12a-RT-RAA

摘要[目的]本研究将CRISPR/Cas12a系统与反转录重组酶介导等温核酸扩增技术(RT-RAA)结合,拟建立一种基于 CRISPR/Cas12a-RT-RAA 的猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)快速检测方法.[方法]分析不同基因型PRRSV全基因组序列,在3'-UTR端保守区设计重组酶介导等温核酸扩增技术(RAA)引物、crRNA及DNA报告底物分子,筛选RT-RAA最佳引物对.表达纯化AsCas12a蛋白,并以质粒为标准品,经RT-RAA扩增后,将产物加入CRISPR/Cas12a系统,建立PRRSV的CRISPR/Cas12a-RT-RAA检测方法,分别以PRRSV、猪圆环病毒2型(PCV2)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪瘟病毒(CSFV)、猪伪狂犬病病毒(PRV)核酸为模板验证建立方法的特异性,以不同浓度的pMD18T-PRRSV为模板验证建立方法的敏感性.以5.62× 106、5.62×103、5.62拷贝数/μL的质粒为模板进行重复性试验,最后进行临床效果评价,将所建立的方法与实时荧光定量逆转录PCR方法进行比较.[结果]本研究成功表达并纯化获得具有良好剪切活性的AsCas12a蛋白,蛋白分子质量大小为196 ku;所建立的CRISPR/Cas12a-RT-RAA方法的检测下限可达5.62拷贝/μL;该方法具有良好的特异性,可特异性检测出PRRSV,不能检出其他猪病病毒PCV2、PEDV、CSFV和PRV,并具有良好的重复性.应用该方法对121份猪组织样品进行检测,与实时荧光定量逆转录PCR的阳性符合率为93.75%,阴性符合率为99.05%,总符合率为99.17%.[结论]本研究成功建立基于CRISPR/Cas12a-RT-RAA的PRRSV快速检测方法,该方法特异性强、灵敏性高、重复性好且不依赖复杂设备,可在现场和基层实验室使用.

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作者 于晶雪 [1] 韦珊珊 [2] 覃绍敏 [2] 吴健敏 [2] 杨丽华 [1] 陈凤莲 [2] 许力士 [2] 秦树英 [2] 华俊 [2] 韦珏 [2] 方芳 [3] 刘金凤 [2] 学术成果认领
作者单位 广西大学动物科学技术学院,南宁 530004;广西壮族自治区兽医研究所,广西兽医生物技术重点实验室,农业农村部(广西)东盟跨境动物疫病防控重点实验室,南宁 530001 [1] 广西壮族自治区兽医研究所,广西兽医生物技术重点实验室,农业农村部(广西)东盟跨境动物疫病防控重点实验室,南宁 530001 [2] 广西大学动物科学技术学院,南宁 530004 [3]
分类号 S852.65
栏目名称
DOI 10.16431/j.cnki.1671-7236.2024.08.002
发布时间 2024-09-09(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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