换一批牛诺如病毒感染相关腹泻犊牛粪便菌群的特征分析
Characteristics of Fecal Microbiota in Calves with Diarrhea Associated with Bovine Norovirus Infection
摘要[目的]比较哺乳期健康犊牛和感染牛诺如病毒(Bovine norovirus,BNoV)的腹泻犊牛粪便菌群多样性和物种组成,初步揭示BNoV感染的腹泻犊牛粪便菌群特征.[方法]首先应用PCR和RT-PCR法对健康和腹泻犊牛粪便中的腹泻相关病原进行检测,然后采用16S rRNA扩增子测序技术对病原检测阴性的健康犊牛粪便(H组)和仅BNoV检测阳性的腹泻犊牛粪便(BNoV组)的微生物多样性、菌群组成和功能进行比较分析.[结果]与H组相比,BNoV组粪便菌群操作分类单元(OTUs)数量和Chao1指数显著升高(P＜0.05),Shannon和Simpson指数极显著降低(P＜0.01).与H组相比,BNoV组粪便变形菌门、埃希-志贺属、丁酸球菌属丰度极显著升高(P＜0.01),放线菌门、柯林斯菌属、巨球型菌属、厄氏菌属、双歧杆菌属、粪杆菌属等丰度极显著或显著降低(P＜0.01;P＜0.05).双歧杆菌属、柯林斯菌属、巨球型菌属、厄氏菌属、粪杆菌属等在H组显著富集,而丁酸球菌属、埃希-志贺属、脆弱拟杆菌、梭菌属等在BNoV组显著富集.与H组相比,BNoV组粪便菌群胞内过程和信号传导、脂质代谢、新陈代谢、异生物质生物降解与代谢、萜类和聚酮类化合物代谢等显著或极显著上调(P＜0.05;P＜0.01),而膜转运、复制与修复、翻译、核苷酸代谢、遗传信息处理等显著或极显著下调(P＜0.05;P＜0.01).[结论]感染BNoV的腹泻犊牛粪便菌群丰富度、多样性、物种组成和功能与健康犊牛显著不同,提示BNoV感染犊牛处于肠道菌群紊乱状态.
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关键词
牛诺如病毒(BNoV)犊牛腹泻粪便菌群16S rRNA扩增子测序Bovine norovirus(BNoV)calf diarrhoeafecal microbiota16S rRNA amplicon sequencing
分类号
S852.65+3
栏目名称
DOI
10.16431/j.cnki.1671-7236.2024.08.026
发布时间
2024-09-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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