鸽F3卵泡转录组构建及卵泡闭锁相关基因分析

Transcriptome Construction of F3 Follicle and Analysis of Genes Related to Follicle Atresia in Pigeons

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摘要[目的]通过对鸽F3卵泡颗粒细胞进行高通量测序筛选出与卵泡闭锁相关的关键基因.[方法]选择产蛋间隔第5(LI5)和7(LI7)天的白羽王鸽各3只,构建F3卵泡颗粒细胞转录文库,利用转录组测序筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对DEGs进行功能注释,利用实时荧光定量PCR对随机选择的5个DEGs进行表达量验证.[结果]LI5和LI7期鸽F3卵泡颗粒细胞的6个cDNA文库中获得41.96～43.62 Mb clean reads,Q30＞92％,比对率为82.21％～85.94％.筛选出LI5和LI7期F3卵泡颗粒细胞DEGs共6 587个,其中2 318个基因上调,4 269个基因下调.GO功能富集分析显示,DEGs主要富集在细胞过程、代谢过程、连接和催化活性功能等条目.KEGG通路富集分析显示,DEGs主要显著富集到聚焦黏附、内质网加工蛋白、卵巢类固醇合成和类固醇激素生物合成等信号通路.结合蛋白-蛋白互作网络和关键通路的DGEs发现,StAR、HSD3B1、MARCH6、BCL2、BOK、CDCA7等基因在鸽卵泡闭锁中发挥了重要作用.实时荧光定量PCR结果显示,5个基因在LI5和LI7期鸽F3卵泡颗粒细胞中表达变化趋势与转录组测序结果一致.[结论]试验获得的6个差异表达基因(StAR、HSD3B1、MARCH6、BCL2、BOK、CDCA7)在鸽卵泡闭锁中发挥重要作用,为进一步了解鸽卵泡闭锁的分子机制提供依据,并为抑制鸽卵泡闭锁、提高鸽产蛋量提供理论基础.