换一批基于转录组测序筛选调控黄羽肉鸡肌肉发育的关键基因
Screening of Key Genes Regulating Muscle Development in Yellow-feathered Chickens Based on RNA-Seq
摘要[目的]为提高黄羽肉鸡肌肉生长发育,本试验通过转录组测序筛选快速型与慢速型黄羽肉鸡胸肌发育的关键基因,并进行功能分析.[方法]以15周龄太行鸡(慢速型黄羽肉鸡)和新浦东鸡(快速型黄羽肉鸡)为研究对象,测定活体重、胸肌重和腿肌重,计算胸肌指数和腿肌指数;采集胸肌和腿肌组织制作HE染色切片分析组织形态学差异,以胸肌组织作为试验样本进行转录组测序,筛选影响黄羽肉鸡肌肉发育相关的差异表达基因(DEGs),并随机选取7个DEGs进行实时荧光定量PCR验证.[结果]太行鸡活体重、胸肌重、腿肌重、胸肌指数、腿肌指数均极显著小于新浦东鸡(P＜0.01).太行鸡胸肌肌纤维横截面积和肌纤维直径极显著或显著小于新浦东鸡(P＜0.01;P＜0.05),肌纤维密度显著高于新浦东鸡(P＜0.05),两者腿肌组织形态学无显著差异(P＞0.05).新浦东鸡与太行鸡胸肌中共获得332个DEGs,其中上调基因75个,下调基因257个.GO功能富集分析发现,DEGs主要注释到平滑肌细胞迁移的正向调节、含胶原蛋白的细胞外基质、黏连蛋白结合等条目.KEGG通路富集分析发现,DEGs主要富集于黏着、ECM-受体的相互作用、MAPK信号通路等.综合GO功能和KEGG通路富集分析共筛选出THBL1、ENSGALG0000000814、LAMA1、PDGFRB基因与胸肌发育密切相关.随机选取7个DEGs进行实时荧光定量PCR验证,结果与转录组测序表达趋势一致,说明测序结果可靠.[结论]试验筛选出THBL1、ENSGALG0000000814、LAMA1和PDGFRB作为胸肌发育重要候选基因,为进一步解析黄羽肉鸡肌肉发育奠定了基础.
更多相关知识
关键词
黄羽肉鸡胸肌生长发育转录组差异表达基因Yellow-feathered chickensbreast musclegrowth and developmenttranscriptomedifferentially expressed genes
分类号
S831.2
栏目名称
DOI
10.16431/j.cnki.1671-7236.2025.03.002
发布时间
2025-03-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
中央引导地方科技发展资金项目（236Z6602G）
保定市科技计划项目（2023;127、2394N012）
- 浏览7
- 被引5
- 下载1
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
