摘要[目的]成骨分化特异转录因子2b(Runx2b)基因在调节鱼类骨骼发育方面具有重要作用.本研究旨在探究淇河鲫(Qihe crucian carp,Carassius auratus)Runx2b基因的特征和表达情况.[方法]参考银鲫Runx2b基因序列(GeneBank登录号:NC_068415.1)结合本地基因组数据进行BLAST比对设计引物,通过PCR分段克隆Runx2b基因,并分别通过DNAStar和Mega 11.0软件进行序列相似性比对及系统发育树构建.通过ORF finder和ProtParam等在线网站进行生物信息学分析.利用实时荧光定量PCR技术检测Runx2b基因在淇河鲫不同发育时期和不同组织中的表达水平.[结果]测序拼接比对后得到Runx2b-A和Runx 2b-B基因,其CDS区均为1 392 bp,编码463个氨基酸.两基因的CDS序列相似性为95.33％,Runx2b-A和Runx2b-B氨基酸序列均与银鲫对应的氨基酸序列相似性最高,分别为98.0％和99.1％.系统进化树分析显示,淇河鲫与银鲫亲缘关系最近.生物信息学分析表明,两个Runx2b蛋白分子式分别为C2206H3409N637O685S18和C2196H3395N633O695S16,均属于亲水性不稳定蛋白,且蛋白质结构主要以无规则卷曲为主,两个蛋白质序列中都存在Runx家族蛋白特征性的Runt-dom和Runx Ⅰ保守结构域.实时荧光定量PCR检测结果表明,Runx2b-A和Runx2b-B基因在淇河鲫整个肌间刺发育阶段整体表达趋势较为一致,肌间刺发育前期(1～5 dph)表达量较高,在肌间刺开始发育后(5～13 dph)表达量逐渐降低,在后期表达量出现上升趋势,尤其在肌间刺发育晚期(25～45 dph)仍有较高的表达量;Runx2b-A和Runx2b-B基因在淇河鲫脑、肝脏、背部肌肉、尾部肌肉等9个组织中均有表达,二者均在脑和肝脏中表达量较高,且显著高于其他组织(P＜0.05),二者在尾部肌肉中的相对表达量均显著高于背部(P＜0.05),但在不同组织中呈现差异表达,具有不同的表达水平.[结论]本研究成功克隆获得两条淇河鲫同源基因Runx2b-A和Runx2b-B的CDS序列,二者氨基酸序列与鲤科鱼类的相似较高,蛋白质序列中存在Runx家族蛋白特征性的Runt-dom和RunxⅠ保守结构域.淇河鲫两个Runx2b基因表达具有广泛的组织分布,但在不同组织中呈现差异表达,具有不同的表达模式;在不同发育时期整体表达趋势较为一致,在肌间刺发育晚期仍有较高的表达量,可为后续深入研究肌间刺发育机制和创制无肌间刺淇河鲫奠定基础.