鹅胰岛素样生长因子2基因启动子区序列分析
Sequence Analysis of Insulin-like Growth Factor 2 Gene Promoter Region in Geese
摘要[目的]启动子的结构和功能在基因转录调控中至关重要.本研究旨在解析鹅胰岛素样生长因子2(IGF2)基因启动子区的结构特征及其转录调控机制,为揭示IGF2基因在鹅生长发育过程中的作用提供理论依据.[方法]基于鹅 IGF2 基因 5'-侧翼区(GCA_040182565.1)2 170 bp 序列,利用 Promoter 2.0、AnimalTFDB 4.0等软件预测其启动子活性区域,分析转录因子结合位点和转录调控元件.使用TBtools软件通过跨物种序列比对分析鹅IGF2基因启动子区的保守性.结合豁眼鹅和浙东白鹅种质间基因组单核苷酸多态性(SNP)分型数据比较不同鹅种质的差异,并对两品种鹅间产蛋期性腺轴组织进行IGF2基因转录表达分析.[结果]鹅IGF2基因启动子活性区域位于1 020~1 932 bp之间,该区域包含CAAT-box、GC-box、TATA-box及与细胞增殖和分化相关的E-box,转录因子Sp1和Irf3可能通过结合这些元件调控基因转录.跨物种序列比对显示,鹅与凤头潜鸭的启动子区高度相似,相似性达92.94%.SNP分型结果显示,豁眼鹅CC基因型比例(89%)明显高于浙东白鹅(25%),而浙东白鹅CT和TT基因型比例(均为38%)高于豁眼鹅(11%).在豁眼鹅和浙东白鹅卵巢组织中,IGF2基因的表达差异较为显著(P<0.05).[结论]鹅IGF2基因启动子区富含Sp1和Irf3等多种转录因子结合位点,是维持IGF2基因稳定表达的关键调控元件.此外,豁眼鹅和浙东白鹅在IGF2基因启动子区1 450 bp处存在1个SNP位点(C/T),可通过影响IGF2基因的表达,进而影响鹅的生长发育和产蛋繁殖性能.
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