换一批基于转录组数据筛选下丘脑-垂体轴中猪卵巢囊肿相关候选基因
Screening for Candidate Genes Related to Porcine Ovarian Cysts in Hypothalamic-pituitary Axis Based on Transcriptome Data
摘要[目的]挖掘下丘脑-垂体轴中猪卵巢囊肿相关候选基因,从神经内分泌系统揭示猪卵巢囊肿的遗传机制.[方法]利用Illumina高通量测序技术分别对3头卵巢囊肿和3头正常发情母猪的下丘脑和垂体进行转录组测序,筛选差异表达基因,并对差异表达基因进行GO功能和KEGG通路富集分析.利用实时荧光定量PCR对下丘脑和垂体中12个差异表达基因表达量进行检测,以验证转录组测序数据的可靠性.[结果]与正常发情母猪相比,在卵巢囊肿母猪下丘脑中共有283个基因存在差异表达,其中173个基因表达下调,110个基因表达上调;在卵巢囊肿母猪垂体中共有1 149个基因存在差异表达,其中563个基因表达下调,586个基因表达上调.基于差异表达基因的表达量、差异倍数及功能富集分析等结果,POMC、KISS1、PMCH、PRLH、VIP、NTRK1、TAC3可能是下丘脑中与猪卵巢囊肿相关的重要候选基因;MC3R、SSTR3、FSHB、OXT、PRL、TSHB、LHB、TAC1可能是垂体中与猪卵巢囊肿相关的重要候选基因.G-蛋白偶联受体信号通路、激素活性、跨膜信号受体活性、神经活性配体-受体相互作用、甲状腺激素合成及ECM受体相互作用等信号通路可能对猪卵巢囊肿的发生起重要作用.实时荧光定量PCR验证的差异基因表达趋势与转录组测序结果基本一致.[结论]转录组测序结果表明,下丘脑中POMC、KISS1、PMCH等基因及垂体中MC3R、SSTR3、FSHB等基因可能是猪卵巢囊肿相关重要候选基因;G-蛋白偶联受体信号通路、激素活性、跨膜信号受体活性等通路可能在猪卵巢囊肿病理过程中起重要作用.研究结果为从神经内分泌系统解析猪卵巢囊肿的遗传机制提供了重要的数据支撑.
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关键词
母猪卵巢囊肿下丘脑-垂体轴转录组差异表达基因sowsovarian cystshypothalamic-pituitary axistranscriptomedifferentially expressed genes
分类号
S814.8
栏目名称
DOI
10.16431/j.cnki.1671-7236.2025.12.018
发布时间
2025-12-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家重点研发计划（2021YFD1301200）
河南省农业科学院自主创新项目（2025ZC72）
河南省农业科学院科技创新团队项目（2024TD37）
河南省科技攻关项目（242102111030）
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