换一批1株携带多黏菌素耐药基因mcr-1的多重耐药大肠杆菌全基因组测序及分析
Whole-genome Sequencing and Analysis of a Multidrug-resistant Escherichia coli Strain Carrying Polymyxin Resistance Gene mcr-1
摘要[目的]了解临床分离的大肠杆菌的耐药性和毒力,为后续禽大肠杆菌病的临床防治提供参考.[方法]本研究通过菌体形态学观察和分子生物学手段对临床分离的1株鸡源病原菌进行分离纯化鉴定,通过药敏试验了解分离菌株的耐药性,利用Illumina NovaSeq测序平台对分离菌株进行全基因组测序.[结果]分离菌株在麦康凯琼脂培养基上呈现粉红色圆形、光滑的菌落,镜检为革兰阴性杆菌,16S rDNA测序结果显示,与GenBank数据库已登录的大肠杆菌(登录号:NR_024570.1)相似性＞98％,经mcr-1基因特异性引物PCR扩增发现,分离的大肠杆菌携带多黏菌素耐药基因mcr-1.药敏试验结果显示,该分离菌株对青霉素类、头孢菌素类、氨基糖苷类、多肽类等12类抗菌药耐药,仅对氯霉素和米诺环素敏感,表现为多重耐药;分离菌株基因组总长为5 057 884 bp;基于KEGG、COG、GO、CAZy等数据库的基因功能注释分析表明,该菌株具备完整的氨基酸转运系统、细胞增殖与分化机制以及代谢功能;通过与CARD和VFDB数据库比对发现,该菌株具有效应器分泌系统、鞭毛、脑内皮侵袭素等毒力基因,且该菌株携带氨基糖苷类、磺胺类、喹诺酮类、肽类、四环素类和β-内酰胺类等多种抗菌药物的耐药基因,这些基因使该菌株表现出较强的毒力与多重耐药性.[结论]本研究分离获得1株鸡源携带mcr-1基因的大肠杆菌,具有多重耐药性与高毒力特征,其基因组结构与环境适应能力共同促成了其强致病性.本研究结果为禽大肠杆菌病的预防和治疗提供了一定的数据参考.
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关键词
大肠杆菌全基因组测序基因功能注释耐药性Escherichia coliwhole-genome sequencinggene functional annotationantimicrobial resistance
分类号
S852.61+2
栏目名称
DOI
10.16431/j.cnki.1671-7236.2025.12.039
发布时间
2025-12-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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