宣和猪ADRP和FASN基因多态性及其与肉质性状的关联分析
Polymorphisms of ADRP and FASN Genes and Their Association with Meat Quality Traits in Xuanhe Pigs
摘要[目的]筛选宣和猪脂肪分化相关蛋白(adipose differentiation-related protein,ADRP)和脂肪酸合成酶(fatty acid synthase,FASN)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,并揭示SNP位点与宣和猪肉质性状的关联性.[方法]以120头宣和猪为试验对象,系统测定了其肉色、大理石纹、pH1、滴水损失和肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)含量等肉质性状指标,对ADRP和FASN基因进行PCR扩增及Sanger测序,筛选SNP位点,并基于最小二乘模型对各SNP位点不同基因型与宣和猪肉质性状进行关联分析.[结果]在ADRP基因第8外显子存在3个SNPs位点,其中rs325276230位点为同义突变,rs321564137和rs81217193位点为错义突变,其优势基因型分别为AA、AA和GG,优势等位基因分别为A、A和G,3个SNPs位点均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05).在 FASN 基因中共检出 6 个 SNPs 位点,包含 4 个同义突变位点(rs337531100、rs324640280、rs81478148、rs319161464)和 2个错义突变位点(rs337267671、rs342967881),其优势基因型分别为TC、CC、TT、GG、GG和CT,优势等位基因分别为C、C、T、G、G和T,其中rs81478148 位点偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01).关联分析结果显示,ADRP与FASN基因SNP位点与宣和猪肉质性状存在显著关联,其中,ADRP基因rs325276230位点AA基因型个体的IMF含量、大理石纹、pH1 极显著或显著高于GG基因型(P<0.01;P<0.05);rs321564137 位点 AA基因型个体的 IMF含量显著高于 AG基因型,肉色显著低于 AG基因型(P<0.05);rs81217193位点GG基因型个体的IMF含量显著高于GA与AA基因型(P<0.05).FASN基因rs337531100位点CC基因型个体的IMF含量显著高于TT与TC基因型(P<0.05);rs324640280位点TT基因型个体的肉色显著高于CT基因型(P<0.05);rs81478148位点CT基因型个体的肉色、pH1 及滴水损失极显著或显著高于TT基因型(P<0.01;P<0.05);rs319161464位点AA基因型个体的pH1 显著低于GG和GA基因型(P<0.05);rs337267671位点GG基因型个体的大理石纹显著高于GA与AA基因型(P<0.05);rs342967881位点TT基因型个体的IMF含量与大理石纹均显著高于CC基因型(P<0.05).[结论]ADRP和FASN基因SNP位点与宣和猪肉质性状存在显著 关 联,其 中 ADRP 基 因 的 rs325276230、rs321564137、rs81217193 位 点 及 FASN 基 因 的 rs337531100 和rs342967881位点可作为改善宣和猪IMF含量的潜在分子标记.
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