鸭星状病毒1型信阳株全基因组扩增及遗传进化分析
Whole Genome Amplification and Phylogenetic Analysis of Duck Astrovirus Type 1 Xinyang Strain
摘要[目的]了解信阳地区鸭星状病毒1型(Duck astrovirus type 1,DAstV1)流行株基因组的演化特征,为进一步研究信阳地区DAstV1的流行、遗传进化及致病特性提供参考依据.[方法]对某养殖场送检的病鸭进行禽腺病毒、禽星状病毒和鸭甲型肝炎病毒等12种常见病毒的PCR/RT-PCR筛查.采集病鸭肝脏组织,无菌处理后经卵黄囊途径接种10日龄SPF鸭胚,连续传代4次,并逐代收集尿囊液进行DAstV RT-PCR鉴定.对分离到的病毒进行全基因组测序,并对ORF1a、ORF1b和ORF2基因序列及其编码蛋白的氨基酸变异位点进行比对分析.[结果]送检病料筛查结果显示,禽星状病毒呈阳性.第 1~4 代鸭胚尿囊液中均呈 DAstV1 阳性,将该病毒命名为HN24XY06.第 4代接种鸭胚全部死亡,死亡胚体发育不良且体表出血.HN24XY06基因组全长 7 755 nt,包含ORF1a、ORF1b和ORF2 3个开放阅读框.序列比对和系统发育分析表明,HN24XY06属于DAstV1毒株,与山东分离株DAstV-SDZZ和DAstV-SDWF亲缘关系较近.ORF1a、ORF1b和ORF2蛋白的氨基酸序列分析显示,存在不同程度的突变,多发生在ORF1a编码的氨基酸序列中.[结论]本研究分离到了1株DAstV1,丰富了信阳地区DAstV1的分子流行病学资料,并为进一步研究DAstV1的致病机制奠定了基础.
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