换一批敲减DDX46后食管鳞癌细胞差异表达基因筛选及相互作用的生物信息学分析
Screening for differential genes of the esophageal squamous cell carcinoma after DDX46 knockdown and bioinformatics analysis of their interaction
摘要目的 探讨DDX46基因对食管鳞癌发生发展的作用机制.方法 应用基因芯片技术检测DDX46基因敲减前后食管鳞癌TE-1细胞中全基因mRNA表达丰度,筛选差异表达的基因,并对其进行生物信息学分析.对表达谱筛选的其中6个差异基因进行实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)定量分析以验证结果的可靠性.结果 按照表达差异倍数之绝对值≥2,且P＜0.05的筛选条件,筛选出差异基因1 006个,其中表达下调基因644个,表达上调基因362个.生物信息分析显示,差异基因主要涉及细胞周期、增殖、凋亡、黏附、能量代谢及免疫应答等生物学过程,磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)为重要节点分子.qRT-PCR检测结果与基因芯片结果的验证符合率为100％.结论 利用生物信息学方法能有效挖掘DDX46敲减后食管鳞癌基因芯片数据,为进一步研究DDX46与食管鳞癌发生发展的关系,以及寻找潜在的治疗靶点提供有价值的线索.
更多相关知识
栏目名称
DOI
10.7507/1007-4848.201907051
发布时间
2020-04-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
- 浏览0
- 被引2
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
