换一批敲减DUS4L对人A549肺腺癌细胞基因表达调控的影响及差异基因分析
Effect of DUS4L knockdown on gene expression regulation of human A549 lung adenocarcinoma cell line and analysis of different genes
摘要目的 探讨类二氢尿苷合酶4(dihydrouridine synthase 4-like,DUS4L)基因在肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)发生发展中的作用机制.方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载LUAD RNA-seq表达数据,评估其临床病理特征与DUS4L mRNA表达的关系;利用EDU增殖实验检测敲减DUS4L对A549细胞增殖能力的影响;利用转录组测序技术检测DUS4L敲减组(KD组)和阴性对照组(NC组)LUAD A549细胞基因表达谱,DESeq2筛选差异表达的基因,利用clusterProfiler软件包对差异基因进行GO功能富集分析.结果 DUS4L mRNA在LUAD组织中的表达高于正常组织,DUS4L上调与LUAD患者的临床病理特征相关.EDU增殖实验提示敲减DUS4L能抑制A549细胞的增殖能力.基因差异分析筛选出差异基因共456个,其中上调基因289个,下调基因167个[|log2(fold change)|＞1且Padj＜0.05],STC2与TRIB3显著下调(P＜0.05).差异基因主要涉及白细胞介素-8的产生、血管生成、血管内皮细胞增殖等通路.结论 DUS4L能广泛调控LUAD细胞的基因表达,为进一步研究DUS4L在LUAD发生发展中的功能和作用以及寻找LUAD新的治疗靶点提供新思路.
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