换一批基于转录组和同位素标记相对与绝对定量技术的宽体金线蛭生品和烫制品差异蛋白研究
Differential protein study between raw and processed products of Whitmania pigra Whitman using transcriptome and isobaric tags for relative and absolute quantitation proteome
摘要目的:通过转录组和蛋白质组技术研究宽体金线蛭生品和炮制品的差异蛋白.方法:以活体宽体金线蛭(Whitmania pigra Whitman)为原料,基于无参转录组进行基因分析,利用转录组信息匹配到Helobdella robusta蛋白质库,然后利用同位素标记相对与绝对定量技术(iTRAQ)蛋白组学技术进行宽体金线蛭的蛋白成分分析,筛选出存在于宽体金线蛭生品及炮制品中的差异蛋白质,并对其进行基因本体(GO)功能聚类分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析以及蛋白质相互作用网络分析(PPI),并结合BIOPEP数据库筛选可能具有抗凝活性的蛋白.结果:本研究筛选到差异表达蛋白共112 种,其中78 种上调蛋白、34 种下调蛋白,并推定出6 条可能具有抗凝作用的差异蛋白.GO功能聚类分析结果表明,在细胞过程(cellular process)、代谢过程(metabolic process)条目富集的差异蛋白数量最多.在差异性方面,大分子复合物(macromolecular complex)、结构分子活性(structural molecule activity)条目差异最显著.KEGG富集分析结果表明,差异蛋白在代谢途径(metabolic pathways)富集到的蛋白最多,ECM-受体相互作用(ECM-receptor interaction)、核糖体(ribosome)、氧化磷酸化(oxidative phosphorylation)差异最显著.结论:本研究结合转录组、蛋白组数据,补充了宽体金线蛭的蛋白质库,筛选出了生品及烫制品的差异蛋白并推定了可能具有抗凝作用的差异蛋白,为宽体金线蛭基因组成、物质基础研究及炮制机制提供参考依据.
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关键词
宽体金线蛭炮制转录组同位素标记相对与绝对定量技术蛋白组差异蛋白Whitmania pigra Whitmanprocessingtranscriptomeisobaric tags for relative and absolute quantitation proteomedifferential proteins
分类号
R917（药物分析）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1003-3734.2024.03.013
发布时间
2024-03-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（82173955）
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