基于网络药理学及分子对接探究黄连治疗关节炎的作用机制

Study on mechanism of Coptidis Rhizoma in the treatment of arthritis based on network pharmacology and molecular docking

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摘要目的:基于网络药理学及分子对接探究黄连治疗关节炎的作用机制.方法:对TCMSP数据库黄连化学成分及相关作用靶点进行检索,Uniprot数据库对靶点进行归一化及标准化处理;通过GeneCards,OMIM以及其他数据库对类风湿关节炎、骨关节炎以及痛风性关节炎疾病靶点进行检索;采用Venny网站获取黄连和3 种关节炎的交集靶点;运用STRING 数据库对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析,用Cytoscape软件构建PPI网络;将共同交集靶点导入DAVID 数据库和Metascape数据库进行生物信息学分析,得出黄连治疗关节炎过程中相关作用通路;将 3 类关节炎对应的化学成分、共有靶点和通路导入Cytoscape软件,构建"化学成分-疾病-靶点-通路"的网络拓扑结构图.结果:共筛选出黄连化学成分 14 种及关节炎潜在作用靶点 176 个,筛选出调控 3 种关节炎的相关靶点分别为5 704,4 098,738 个,交集靶点共29 个;KEGG分析结果显示黄连治疗关节炎与癌症的发病途径通路、糖尿病并发症的AGE-RAGE信号通路、Hepatitis B作用通路等有关.结论:黄连中黄连素、巴马汀、黄连碱、氧化小檗碱等核心成分可能通过调控白细胞介素-17(interleukin-17,IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路等改善炎症,发挥抗关节炎的作用.