法洛四联症患儿类视黄酸受体α基因启动子区序列分析

Genetic analysis of the RXRA gene promoter in tetralogy of Fallot patients

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摘要目的对法洛四联症(TOF)患儿类视黄酸受体α(RXRA)基因启动子区序列进行分析,探讨RXRA基因变异与TOF的关联性.方法采取病例对照研究方法,以2007年4月至2012年12月心导管检查及外科手术证实为TOF患儿为TOF组,以同时期年龄和性别与TOF组匹配的健康儿童为对照组.采集静脉血,提取基因组DNA,PCR扩增RXRA基因转录起始位点(TSS)上游1 417 bp的启动子区序列,扩增产物采用ABI Prism Bigdye系统进行测序.结果 TOF组纳入213例(男135例,女78例),平均年龄1.8岁;对照组纳入500名(男310名,女190名),平均年龄2.5岁.①RXRA基因TSS上游1 191 bp处检测出1个杂合突变,即-1 191A>AG(TSS定为+1);检测出3个新发SNP,即-1 287C>CT、-800C>CA及-760C>CT.②利用http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.html网站进行分析,发现在该4个位点及其附近有多个转录因子结合位点.-1 191A>AG导致新的CpG位点产生,-800C>CA导致原有CpG位点消失.这些新产生的CpG位点的甲基化可能会影响转录因子的结合,从而影响RXRA基因转录水平,进一步导致RXRA蛋白水平的变化.结论 TOF患儿RXRA基因启动子区序列变化可能通过影响RXRA表达水平而导致TOF的发生.