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使用R语言metaMA程序包实现基因表达谱数据的Meta分析

Conducting meta-analysis of gene expression data using R package metaMA

摘要基因芯片技术原理为杂交测序,即碱基互补配对原则.基因芯片技术发展迅速,是进行基因分析的有力工具.由于基因芯片类型及其数据格式的多样性,对基因组数据进行全面和完整的分析具有重要意义.R是一个免费、开源的统计分析软件,通过加载不同包,能实现对不同类型基因芯片的分析.使用基于R语言的metaMA包前,需要把不同研究基因转化为统一格式.通过加载metaMA包,使用Meta分析筛选出差异表达的基因.基因在病例组与对照组中的表达是否有差异,不同的实验可能得出不同的结论.Meta分析可综合这些实验结果,使结论更可靠.本文以3例口腔鳞状细胞癌研究获得的基因组数据为例,介绍如何使用R语言metaMA包找出不同研究中差异表达的基因.

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