医学文献 >>
  • 检索发现
  • 增强检索
知识库 >>
  • 临床诊疗知识库
  • 中医药知识库
评价分析 >>
  • 机构
  • 作者
默认
×
热搜词:
换一批
论文 期刊
取消
高级检索

检索历史 清除

基于孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析的心肌病潜在靶基因筛选与验证

Screening and validation of potential target genes for cardiomyopathy based on Mendelian randomization and Bayesian colocalization analysis

摘要目的 从基因层面筛选并鉴定与心肌病治疗相关的潜在靶点,为该类疾病的防控提供初步理论依据.方法 首先采用基于汇总数据的孟德尔随机化(SMR)方法,从eQTLGen数据库(基因组织来源为全血)中筛选出可能显著影响心肌病风险的潜在靶基因.其次,从GTEx数据库(基因组织来源为心肌组织)中提取同一批靶基因,并评估其对心肌病风险的遗传影响.再次,通过贝叶斯共定位分析验证这些靶基因与心肌病的遗传相关性,即它们是否共享因果变异位点.最后,利用SMR方法评估这些靶基因对3种特殊类型心肌病的风险影响,这3种类型包括疾病相关心肌病(如糖尿病心肌病等有明确诱因的心肌病)、药物性心肌病及酒精性心肌病.结果 在eQTLGen数据库的15 639个备选基因中筛选出10个潜在靶基因,这些基因在全血中的表达与心肌病风险显著相关.其中,NARFL、HAGHL、FAM173A、CCDC136、IGHMBP2、CCDC116及RNASEH2C七个基因在全血中的表达水平升高可显著增加心肌病的发病风险(P=2.67×10-4、2.08×10-5、2.14E×10-5、2.06×10-6、5.27×10-5、7.12×10-4、1.21×10-5);而SPATA24、SNX32及MRPL21这3个基因在全血中的表达水平升高则显著降低心肌病风险(P=1.46×10-4、5.56×10-4、5.58×10-5).在GTEx的心肌组织数据库中亦筛查出上述10个基因,并且这些基因在心肌组织中的表达对心肌病风险的影响与其在全血中表达时的作用一致(P<0.05).贝叶斯共定位分析结果进一步支持上述SMR分析得出的结论,所有靶基因的共享因果变异后验概率均大于50%.然而,这10个靶基因对疾病相关心肌病、药物性心肌病及酒精性心肌病的风险影响均未达到显著性(P>0.05).结论 NARFL、HAGHL、FAM173A、CCDC136、IGHMBP2、CCDC116、RNASEH2C、SPATA24、SNX32及MRPL21共10个在全血及心肌组织中表达的基因可能成为心肌病的重要治疗靶点.

更多
广告
DOI 10.3969/j.issn.1674-4055.2025.09.06
发布时间 2025-11-04(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
  • 浏览0
  • 下载0
中国循证心血管医学杂志

加载中!

相似文献

  • 中文期刊
  • 外文期刊
  • 学位论文
  • 会议论文

加载中!

加载中!

加载中!

加载中!

法律状态公告日 法律状态 法律状态信息

特别提示:本网站仅提供医学学术资源服务,不销售任何药品和器械,有关药品和器械的销售信息,请查阅其他网站。

  • 客服热线:4000-115-888 转3 (周一至周五:8:00至17:00)

  • |
  • 客服邮箱:yiyao@wanfangdata.com.cn

  • 违法和不良信息举报电话:4000-115-888,举报邮箱:problem@wanfangdata.com.cn,举报专区

官方微信
万方医学小程序
new智医 翻译 充值 订阅 收藏 移动端

官方微信

万方医学小程序

使用
帮助
Alternate Text
调查问卷