GEPIA数据库在疾病基因表达分析中的应用介绍
Introduction to the application of GEPIA database in disease gene expression analysis
摘要近年来,随着大量分子生物学实验室的基因组测序数据不断产生,研究人员能够从分子角度诠释疾病的产生和发展,探索单基因或基因组在疾病中的表达水平,但基因所蕴含的序列特征、表达规律、基因间的相关性、代谢产物间的相互作用等非常复杂,导致研究人员理解基因在疾病中的关键作用时往往束手无策,基于基因表达水平值的交互式分析平台(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)数据库的诞生很好地解决了这一问题,该数据库以分析TCGA 和 GTEx 数据为主,通过检索基因在肿瘤样本中的表达量,分析基因在肿瘤产生发展中的作用,评估基因间的共表达水平,计算其与肿瘤预后的关系,通过该数据库,研究人员可一站式分析目标基因,为疾病的治疗靶点提供数据支撑,实现精准的疾病预后分类及诊断,填补肿瘤基因组学、治疗靶点的综合信息平台空缺,促进了广泛研究领域的生信信息学数据挖掘,为疾病临床治疗和诊断提供全新的视角.
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