西黄丸抗弥漫大B细胞淋巴瘤的作用机制预测与验证
Mechanism prediction and verification of Xihuang pill against diffuse large B-cell lymphoma
摘要目的 探讨西黄丸抗弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的作用机制.方法 基于TCMSP、GeneCards、DisGeNET等数据库筛选西黄丸活性成分及DLBCL相关疾病靶点;利用String数据库和Cytoscape软件,构建蛋白质-蛋白质相互作用网络以筛选核心成分与核心靶点,然后进行基因本体功能和京都基因与基因组数据库通路富集分析;利用GEPIA和PanCanSurvPlot数据库分析核心靶点的临床相关性;进一步对核心成分与核心靶点进行分子对接和分子动力学模拟验证,并采用分子力学泊松-玻尔兹曼表面积(MM-PBSA)算法计算结合自由能.采用CCK-8法、流式细胞术及Western blot法验证西黄丸对DLBCL的作用及相关分子机制.结果 网络药理学共筛选出108个西黄丸活性成分和410个西黄丸治疗DLBCL的潜在靶点,获得17 beta-estradiol(17β-雌二醇)、quercetin(槲皮素)等6个核心成分,肿瘤蛋白53(TP53)、酪氨酸蛋白激酶Src(SRC)等10个核心靶点.富集分析显示,西黄丸抗DLBCL主要涉及凋亡信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路等.临床相关性分析显示,TP53、SRC在DLBCL样本中高表达,且与患者不良预后相关(P<0.05).分子对接、分子动力学模拟及MM-PBSA结合自由能计算证实,SRC-槲皮素复合物具有更强而稳定的结合亲和力.体外实验结果显示,西黄丸可浓度依赖性抑制DLBCL细胞的增殖;与对照组比较,西黄丸中、高浓度组可显著诱导SU-DHL2和SU-DHL4细胞凋亡,显著降低SU-DHL4细胞中SRC蛋白、磷酸化PI3K(p-PI3K)/PI3K、p-Akt/Akt的表达(P<0.05).结论 西黄丸可能通过调控SRC/PI3K/Akt信号通路抑制DLBCL细胞增殖并诱导其凋亡.
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