换一批猪圆环病毒Ⅱ型结构蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位预测
Prediction of the secondary structure and B cell epitope for the cap protein of PCV-Ⅱ
摘要本研究以猪圆环病毒(porcine circovirus,PCV)Ⅱ型的基因组序列为材料,采用Gamier-Robson方法、Chou-Farplus 方法和Karplus-Schulz方法预测了其结构蛋白的二级结构,用Kyte-Doolittle方法对结构蛋白的亲水性进行了分析,用Emini方法预测了结构蛋白的表面可能性,以Jameson-Wolf方法预测了蛋白的抗原指数.然后综合评价了PCV-2型结构蛋白的B细胞抗原表位.结果表明,PCV-2结构蛋白形成α螺旋结构的能力较差,但是该蛋白含有较多的β折叠和转角结构,因而该蛋白具有丰富的二级结构.分析结果还表明结构蛋白具有多处抗原指数较高的区段,其中羧基端含有潜在的B细胞优势抗原表位,因此其在免疫学中的地位也应当引起重视.本研究将为猪圆环病毒的反向疫苗学的研究提供一定的理论依据.
更多相关知识
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1008-0589.2005.06.007
发布时间
2005-12-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
- 浏览0
- 被引24
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
