换一批鸡传染性支气管炎病毒ck/CH/LHLJ/090908株的基因组特性研究
Molecular characteristics of avian infectious bronchitis virus ck/CH/LHLJ/090908 isolated from vaccinated commercial chicken flocks
摘要为了解传染性支气管炎病毒(IBV) H120疫苗病毒株的变异情况,本研究利用设计的16对引物扩增分离株ck/CH/LHLJ/090908的基因组序列,并采用3'-RACE和5'-RACE技术,扩增得到该病毒全基因组序列.通过与已发表参考病毒株的全基因组序列进行比较分析,结果表明该分离株基因组全长为27 609 nt,其基因排序未发生改变,纤突蛋白裂解位点为533RRFRR537.遗传进化分析表明该分离株与H120疫苗株的基因组具有高度同源性(99.7％),进化亲缘关系最近.对其基因组序列进行进一步的分析表明,该分离株的E基因发生了248 nt～280 nt连续33个核苷酸的缺失,导致其编码的E蛋白缺失11个氨基酸,推测该分离株为H120疫苗株在鸡群中自然传代进化的变异株.
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关键词
鸡传染性支气管炎病毒基因组序列序列分析点突变缺失avian infectious bronchitis virusgenome sequencesequence analysispoint mutationdeletion
分类号
S852.65
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1008-0589.2014.11.03
发布时间
2014-12-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家蛋鸡产业技术体系（(NYCYTX-41-G10)）
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