十足目虹彩病毒重组酶介导等温扩增检测方法的建立与应用
Establishment and application of the RAA method for detection of Decapod iridescent virus 1(DIV1)
摘要十足目虹彩病毒(DIV1)的宿主范围和流行区域广泛,已成为近些年危害我国虾类养殖的重要病原之一.为建立一种DIV1重组酶介导等温扩增(RAA)检测方法,本研究根据DIV1 ATPase基因保守序列设计了 2对引物和1条探针,经过反应条件优化,结果显示,引物对DIV1-RAA-F1/R1与探针DIV1-RAA-P的组合扩增效率较高,在配制 50 μL反应体系中采用浓度为 10 μmol/L 的 DIV1-RAA-F1/R1 各 2 μL,10 μmol/L 的 DIV1-RAA-P 0.6 μL,42 ℃恒温条件下反应15 min即可高效检出DIV1,初步建立了 DIV1 RAA检测方法.提取DIV1、白斑综合征病毒(WSSV)、传染性皮下和造血器官坏死病病毒(IHHNV)、虾肝肠胞虫(EHP)、致急性肝胰腺坏死病副溶血弧菌(VpAHpND)、嗜水气单胞菌(Ah)及弗氏柠檬酸杆菌(Cf)等病原的DNA为模板,利用该方法检测.结果显示,该方法仅能检测到DIV1,与其他虾类病原均无交叉反应;以浓度为1.05×107拷贝/μL~1.05×100拷贝/μL的pUC57-DIV1质粒标准品为模板,利用该方法检测.结果显示,该方法的检测限为1.05×101拷贝/μL,与qPCR的检测限一致;以同一批次和不同批次提取的2个不同浓度的质粒标准品pUC57-DIV1为模板,进行重复性试验,结果显示,该方法对相同浓度质粒标准品的检测结果均一致,扩增曲线差异较小.利用该RAA方法与报道的qPCR、套式PCR方法分别对60份克氏原螯虾组织样品提取的DNA进行检测并对比结果,结果显示RAA方法和qPCR方法均检测到6份DIV1阳性样品,而套式PCR仅检测到5份阳性样品,RAA方法和qPCR方法的符合率达100%,敏感性较套式PCR高.本研究建立的DIV1 RRA检测方法特异性强、灵敏度高,操作简单,反应时间短,结果可靠,可用于DIV1临床和现地的快速检测.
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