罗氏沼虾源弗氏柠檬酸杆菌的分离鉴定及致病性分析
Isolation,identification and pathogenicity analysis of Citrobacter freundii from Macrobrachium rosenbergii
摘要为探究患病罗氏沼虾的病原及其感染的防治措施,本研究从浙江省某养殖场采集10只患病罗氏沼虾的肝胰腺、鳃及肌肉样品分离获得一株优势菌.通过对该优势菌经革兰氏染色镜检及生化鉴定,结果表明分离菌为弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii).采用PCR分别扩增分离菌的16S rRNA和gyrB基因序列,测序后经BLAST检索与这两种基因同源性均最高的菌株;通过MEGA 7.0软件中的Clustal W方法将分离菌与从GenBank中获得的同源性较高的菌株序列进行多序列比对,采用MEGA 7.0软件中的邻接法构建分离菌与上述菌株16S rRNA和gyrB基因的系统发育树.BLAST检索结果显示,分离菌与弗氏柠檬酸杆菌(KC210829.1)16S rRNA基因序列的同源性高达99.93%;与弗氏柠檬酸杆菌(KF156750.1)gyrB基因序列的同源性达98.76%.16S rRNA和gyrB基因的进化树结果显示,分离菌均与弗氏柠檬酸杆菌聚为一支,且支持率高达99%.进一步表明引起罗氏沼虾发病的病原为弗氏柠檬酸杆菌.将分离菌分别以1.02×109 cfu/mL~1.02×104 cfu/mL 6种浓度感染健康罗氏沼虾,每日观察并记录罗氏沼虾的发病症状及死亡率,根据Probit回归法计算分离菌对罗氏沼虾的半数致死量(LD50).结果显示,1.02×106 cfu/mL以上浓度的弗氏柠檬酸杆菌均能够导致罗氏沼虾出现体型消瘦、行动迟缓无活力的症状,1.02×105 cfu/mL以下浓度的弗氏柠檬酸杆菌并不致罗氏沼虾出现症状.经统计该菌株对罗氏沼虾的LD50为1.01×107 cfu/mL,表明该菌株对罗氏沼虾的致病性较强.采用PCR分别检测该分离菌株的定居因子基因(cfa)、尿素酶基因簇(ureG、ureF、ureE、ureD)、Vi抗原基因(viaB)、外膜蛋白基因(ompX)等7种毒力相关基因,结果显示该菌株分别扩增到375 bp(cfa)、119 bp(ureG)、300 bp(ureF)、247 bp(ureE)、243 bp(ureD)、875 bp(viaB)及250 bp(oompX)的7种毒力基因.采用K-B纸片扩散法测定分离菌对10类共35种药物的敏感性,结果显示该分离菌对β-内酰胺类的头孢他啶和头孢曲松、多肽素类的多黏菌素B、氨基糖苷类的庆大霉素以及拉氧头孢这5种药物敏感,对β-内酰胺类的青霉素、氯霉素类的氟苯尼考、多肽类的万古霉素及苯唑醂、克林霉素和新生霉素等27种药物呈不同程度的耐药性,且为多重耐药菌.综上所述,本研究从患病罗氏沼虾中分离到了一株弗氏柠檬酸杆菌,该菌携带多种毒力基因,对罗氏沼虾的致病性较强,为进一步研究弗氏柠檬酸杆菌对水产动物的致病性及对罗氏沼虾弗氏柠檬酸杆菌病的防治提供参考依据.
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