换一批犬瘟热病毒YB株编码基因的遗传进化与生物信息学分析
Genetic evolution and bioinformatics analysis of coding genes in canine distemper virus YB strain
摘要为了深入了解中国延边地区犬瘟热病毒(CDV)的流行及变异情况,本实验室对采集的10份疑似患CDV犬的口鼻拭子样品经胶体金试纸条检测后,对阳性样品进一步经RT-PCR检测,并扩增该病毒的各编码基因,采用DNAStar对各编码基因进行同源性及遗传进化分析,采用DataMonkey对该病毒株进行进化选择压力分析.结果显示:该样品经RT-PCR和胶体金检测均为CDV阳性,将该病毒株命名为CDV-YB;将CDV-YB H基因与世界各地CDVH基因序列对比分析并构建该基因的进化树,结果显示:CDV-YB株基因型为亚洲1型,其中与黑龙江ZYL株(KX488865)的亲缘关系最近,与美国Snyder Hill标准株(JN896987)的同源性为90.8％;采用DataMonkey预测CDV-YB株的选择压力结果显示,该病毒株的7个关键蛋白均有不同方向的进化特征.上述结果表明CDV仍不断变异,亚型之间存在进化.本研究对CDV-YB株的各编码基因进行了遗传进化分析及选择压力分析,为CDV药物开发及疫苗制备提供了科学依据.
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分类号
S852.65
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1008-0589.202402007
发布时间
2025-07-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
吉林省教育厅十三五科学技术项目（JJKH20200521KJ）
吉林省自然科学基金（20210101368JC）
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