换一批湖南省腹泻牛中新型牛肠道病毒变异株的分离与鉴定
Isolation and identification of novel bovine enterovirus variants in diarrheic cattle from Hunan Province,China
摘要为分离鉴定湖南省牛养殖场腹泻牛的致病病原,并分析其分子生物学特征,本研究将采集的腹泻牛肛拭子样品处理后接种Vero细胞分离和噬斑纯化病原,采用随机引物扩增后高通量测序获得2株牛肠道病毒(BEV)(WG-X4和NKY-2-1株).参照测序结果,采用Premier 6.0软件设计BEV分段扩增引物扩增2株BEV的各基因片段,测序后拼接获得2株病毒的全基因组.全基因组比较分析结果显示WG-X4和NKY-2-1株基因组序列的同源性达99.3%,两株BEV均与GenBank中我国内蒙古BHM26株基因组同源性最高(82.9%),两株病毒与已知BEV全基因组序列存在较大差异,均为BEV变异株.基于VP1、P1和2C+3D区域进行系统进化分析,结果显示,这两株病毒均归类为EV-F2亚型.进一步对病毒编码的氨基酸分析显示,WG-X4和NKY-2-1株与已知的BEV-F株氨基酸序列的同源性最高为95%.对BEV氨基酸序列各功能区的选择压力分析结果显示,WG-X4和NKY-2-1株仅在P1区与其他BEV差异较大,但二者编码的氨基酸均为同义翻译,表现为高度保守,推测病毒在进化过程中主要受负选择(纯选择)的影响,非同义突变因不利于病毒复制或其对宿主适应性而被选择性淘汰.进一步重组分析发现该病毒基因组的5'UTR(nt1～nt204)、VP4区(nt616～nt1046)、P2和P3蛋白编码区(nt5004～基因组3'端)可能发生过重组事件.本研究首次在我国南方牛群中分离鉴定到2株BEV EV-F2亚型变异株,该结果为研究我国BEV的流行及演化提供了重要基因组数据,并为BEV感染的防控供了参考数据.
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关键词
牛肠道病毒EV-F2型遗传多样性重组分析选择压力bovine enterovirusEV-F2 subtypegenetic diversityrecombination analysisselective pressure
分类号
S852.65
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1008-0589.202501023
发布时间
2025-11-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（32272975）
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