换一批基于生物信息学探讨MEF2C在铁死亡相关哮喘中的分子机制
Molecular mechanism of MEF2C in ferroptosis-related asthma based on bioinformatics
摘要目的 基于生物信息学方法筛选铁死亡相关哮喘的关键基因,并探讨其在哮喘发生中的分子机制.方法 通过GEO数据库获取哮喘相关数据集,并在铁死亡数据库(FerrDB)中下载铁死亡相关基因,两者取交集得到铁死亡相关哮喘差异表达基因.通过LASSO回归和SVM-RFE算法进一步筛选核心基因.对上述筛选所得基因进行分子生物学验证,并通过哮喘小鼠中的miRNA微阵列数据联合miRWalk与TargetScan预测上游miRNA.结果 首先从GSE43696数据集中筛选出在中、重度哮喘中表型一致的差异表达基因212个,其中包含5种铁死亡相关基因,分别为HCAR1、NOS2、MEF2C、IL6和NOX1.SVM-RFE算法显示,MEF2C对模型的影响最大,实验验证后发现其mRNA与蛋白产物的表达在哮喘小鼠中均下调,且主要在气道上皮细胞核内表达.靶向MEF2C的miRNA预测分析结果发现在哮喘小鼠中上调miR-2861表达可能靶向MEF2C,且miR-2861的表达在IL-17A敲除后显著下调.结论 MEF2C是铁死亡相关哮喘的关键调控因子,其表达下调可能与IL-17A介导的miR-2861表达上调有关.
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分类号
R392.8（医学免疫学）
栏目名称
DOI
10.12007/j.issn.0258-4646.2025.03.002
发布时间
2025-05-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（82160004）
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