摘要目的 研究中药复方桃红四物汤(Tao Hong Si Wu de-coction,THSWD)治疗大脑中动脉闭塞(middle cerebral artery occlusion,MCAO)大鼠长链非编码 RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的表达,并确定THSWD治疗MCAO大鼠可能的分子机制.方法 从对照组、MCAO组和MCAO+TH-SWD 组各获得3个大脑半球组织.采用RNA测序技术鉴定三组中的lncRNA基因表达.鉴定了 THSWD调节的ln-cRNA 基因,然后构建了 THSWD调节的lncRNA-mRNA网络.通过MCODE插件鉴定lncRNA-mRNA网络的模块.基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书数据库(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)用于分析富集的生物功能和信号通路.鉴定了 THSWD调节的ln-cRNA 的顺式和反式调控基因.采用逆转录实时定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)验证lncRNA.分子对接用于验证lncRNA-mRNA网络靶点和通路相关蛋白结合能力.结果 在MCAO大鼠中,THSWD共调节了 302个lncRNA.生物信息学分析表明,一些核心lncRNA可能在THSWD治疗MCAO大鼠中发挥重要作用,此外,我们进一步发现THSWD可能也通过lncRNA-mRNA网络以及网络富集的补体和凝血级联反应等多通路治疗MCAO大鼠.分子对接结果表明,THSWD活性化合物没食子酸和苦杏仁苷与蛋白质靶点具有一定的结合能力.结论 THSWD可以通过调节ln-cRNA 保护MCAO大鼠脑损伤,为THSWD治疗缺血性中风提供了新见解.