海马G蛋白偶联雌激素受体1参与癫痫调控的转录组学研究

Transcriptomic study of hippocampal G protein-coupled estrogen receptor 1 involved in epilepsy regulation

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摘要目的本研究分别将野生型(WT)、Gper1敲低(Gper1-KD)大鼠海马组织进行转录组测序,探讨G蛋白偶联雌激素受体 1(G-protein coupled estrogen receptor 1,GPER1)影响癫痫发病可能的信号通路和分子机制.方法海马组织进行RNA提取和cDNA文库构建,与NCBI数据库大鼠基因组及基因注释比对,通过FPKM值,筛选组别间差异表达基因(DEGs).将DEGs进行GO富集、KEGG富集分析,构建蛋白互作网络,利用RT-qPCR法对关键DEGs进行验证.结果 Gper1-KD 组与 WT 组相比,筛选(Fold change＞2且FDR＜0.01)后,检测到DEGs 2 253个,其中上调基因1 380个,下调基因873个;GO结果显示,DEGs主要分布在淋巴细胞趋化性、细胞分泌、巨噬细胞趋化性、中性粒细胞趋化性、血管生成正向调控等生物过程;KEGG结果显示,DEGs相关分子信号通路主要有癌症信号通路、PI3K-Akt通路、癌症蛋白聚糖相关信号通路、细胞黏附相关通路、MAPK信号通路等;RT-qPCR 结果表明,Mapk12、Pdpk1、Foxo3、Camk2d、Pik3cg 等基因表达水平差异具有显著性.结论 MAPK、TNF信号通路在GPER1影响癫痫发生中可能起关键作用,GABA能神经元和Pik3cg在GPER1影响癫痫易感性方面可能发挥重要作用.