基于生物信息学和体外实验验证的肾康注射液治疗肾纤维化作用机制研究

Mechanism of Shenkang injection in treatment of renal fibrosis based on bioinformatics and in vitro experimental verification

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摘要目的利用生物信息学及体外实验探讨肾康注射液(Shenkang injection,SKI)治疗肾纤维化(renal fibrosis,RF)的作用机制与物质基础.方法利用GEO数据库筛选RF差异表达基因,借助CMAP数据库,基于基因表达谱相似性原理,重定位出具有调控RF作用的药物,然后通过分子指纹相似性分析筛选出SKI潜在治疗RF的成分;同时基于网络药理学预测SKI调控RF的核心靶点及通路;最后,通过分子对接和细胞实验进行验证.结果基于GEO数据库筛选到2个RF相关的数据集,CMAP重定位到3个共同的RF治疗药物(saracatinib、dasatinib、PP-2),分子指纹相似性分析发现,RF 治疗药物与 salvianolic acid B、hydroxysafflor yellow A等5个SKI成分的结构相似性较高.分子对接结果发现,salvianolic acid B、hydroxysafflor yellow A 等成分与 SKI 调控的潜在治疗RF的核心靶标MMP1、MMP13等均有良好的结合能力.网络药理学分析提示,SKI核心靶点主要富集在Relaxin和AGE-RAGE等信号通路.细胞实验表明,SKI可显著降低RF模型细胞AGE-RAGE信号通路中AGER、NFKB1、COL1A1、SERPINE1、VEGFC 和 Relaxin 信号通路中MMP1、MMP13的mRNA表达水平,显著升高RXFP1的mR-NA表达水平.结论 SKI可通过调控Relaxin和AGE-RAGE信号通路来发挥治疗RF的作用,其物质基础可能为salvianolic acid B、hydroxysafflor yellow A 等成分.

作者 孟高全 ^[1] 张明亮 ^[2] 陈小菲 ^[2] 王晓艳 ^[2] 李伟霞 ^[2] 张岱 ^[3] 蒋露 ^[3] 李明格 ^[1] 张小帅 ^[1] 孟伟亭 ^[1] 韩冰 ^[1] 唐进法 ^[2] 学术成果认领

作者单位 河南中医药大学第一附属医院药学部,河南郑州 450003;河南中医药大学药学院,河南郑州 450046 ^[1] 河南中医药大学第一附属医院药学部,河南郑州 450003;河南省中药临床应用、评价与转化工程研究中心、河南省中药临床药学中医药重点实验室、河南省中药安全评价与风险防控工程研究中心,河南郑州 450003 ^[2] 河南中医药大学第一附属医院药学部,河南郑州 450003;河南中医药大学第一附属医院检验科,河南郑州 450003 ^[3]

关键词肾康注射液肾纤维化生物信息学药物重定位实验验证作用机制 Shenkang injection renal fibrosis bioin-formatics drug repositioning experimental verifica-tion mechanism of action

分类号 R289.5 R322.61 R319 R394 R692

栏目名称

泌尿与生殖系统药理学

DOI 10.12360/CPB202403092

发布时间 2024-10-15

基金项目

国家自然科学基金（No82173993）；国家自然科学基金（No82004021）；河南省高校科技创新团队（No23IRTSTHN026）；河南省中医管理局基地专项课题（No2022ZY1029）