换一批
换一批综合微阵列数据分析与动脉粥样硬化程序性细胞死亡相关的lncRNA-miRNA-mRNA竞争内源性网络
Novel lncRNA-miRNA-mRNA competing endogenous RNA triple networks associated programmed cell death in atherosclerosis
摘要目的 基于生物信息学挖掘与程序性细胞死亡相关的ceRNA网络在AS病理生理过程中的作用,以期为AS的诊断和治疗提供新的靶点.方法 从GEO数据库筛选GSE97210和GSE28858数据集,筛选差异表达的lncRNA、mRNA 和 miRNA,而后基于 ceRNA 理论在 Cytoscape3.7.2 软件中构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络.其次对ceRNA网络中的mRNA进行GO和KEGG富集分析.再将ceRNA网络中的mRNA与自噬、焦亡和铁死亡相关的基因取交集,构建与程序性细胞死亡相关的ceRNA网络.结果 共获得1 208 个 DElncRNA、4 723 个 DEmRNA 和 139 个 DEmiRNA.构建了一个由 64个lncRNA、8个miRNA和167个mRNA组成的ceRNA网络.ceRNA网络中的mRNA主要在转录和迁移的正调控以及蛋白结合等生物功能和PI3K-Akt信号通路、mTOR信号通路等信号通路中显著富集.最终,构建了7种lncRNA介导的ceRNA对焦亡的调控途径和23种ln-cRNA介导的对铁死亡与自噬的调控途径.结论 该研究构建了与程序性细胞死亡相关的ceRNA网络,有助于我们了解程序性细胞死亡导致AS的作用机制.
更多相关知识
关键词
动脉粥样硬化GEO数据库铁死亡自噬焦亡CeRNA网络atherosclerosisGEO databASeferropto-sisautophagypyroptosisceRNA network
栏目名称
网络药理学
DOI
10.12360/CPB202404056
发布时间
2025-01-21
- 浏览2
- 被引0
- 下载1
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
