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基于全转录组测序探讨褪黑素抑制神经胶质瘤细胞增殖的机制

Study on the inhibition mechanism of melatonin for neuroglioma cell proliferation based on whole transcriptome sequencing

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摘要目的全转录组测序检测神经胶质瘤细胞非编码RNA(ncRNA)表达谱并构建ceRNA网络,揭示ncRNA参与褪黑素抑制神经胶质瘤细胞增殖的分子机制.方法 0、2、4、6、8 mmol·L-1褪黑素干预神经胶质瘤细胞24、48、72 h,CCK-8检测褪黑素对细胞增殖的抑制作用;0、4 mmol·L-1褪黑素干预U251细胞24h后,全转录组测序检测差异表达miRNA(DEmiRNA)、lncRNA(DElncRNA)、mRNA(DEmR-NA),对DEmRNA进行GO和KEGG富集分析;构建ceRNA网络,采用qRT-PCR验证ceRNA关键基因表达.结果褪黑素呈时间-剂量依赖性抑制神经胶质瘤细胞增殖;全转录组测序筛选出0 mmol·L-1与4 mmol·L-1褪黑素组DEm-RNA 5049 个、DElncRNA 635 个、DEmiRNA 146 个;DEmRNA主要富集在铁死亡、mTOR信号通路、FoxO信号通路、细胞周期等癌症相关信号通路;ceRNA网络包含4个lncRNA、3个 miRNA 和 48 个 mRNA,qRT-PCR 验证 U251 细胞 hsa-miR-129-5p、hsa-miR-362-5p、LINC00707 和 SLC16A1-AS1 表达与测序结果一致,U87细胞的基因表达与测序结果基本一致.结论褪黑素通过ncRNA差异表达,影响癌症相关信号通路,进而抑制神经胶质瘤细胞增殖;LINC00707、SLC16A1-AS1、hsa-miR-129-5p、hsa-miR-362-5p 构成的 ceRNA 网络可能参与褪黑素抑制神经胶质瘤细胞增殖的分子机制.