基于转录组和蛋白质组等多组学的遗传推断探究肺癌潜在治疗靶点
Genetic imputation of lung cancer transcriptome,proteome and multiomics illuminates new therapeutic targets
摘要目的 通过多组学等方法来推断与肺癌治疗相关的新型治疗靶点和药理靶点,为开发更加个性化和有效的治疗策略提供新的方向.方法 采用全基因组关联研究(GWAS)数据分析、泛癌、单细胞、转录组学和蛋白质相互作用等进行分析.我们分析了与肺癌相关的生物标志物和治疗靶点.本研究识别了与肺癌进展密切相关的关键生物标志物,并探讨了这些生物标志物与病毒感染之间的相互关系.结果 根据KEGG通路注释,代谢过程相关基因的数量显著增加.研究结果表明,免疫细胞、肠道菌群及代谢中间产物在肺癌的发展中发挥着至关重要的作用.具体而言,代谢产物中丙氨酸、异亮氨酸成为治疗的核心因素.IgD+CD24+和IgD+CD24-B细胞亚群已成为免疫逃逸与治疗反应的核心因素.同时,拟杆菌属和罗氏菌属通过调节短链脂肪酸的水平,改变宿主的免疫反应和肿瘤微环境,为癌症治疗开辟了新的研究路径.结论 通过多组学分析方法结合转录组学和蛋白质组学分析技术,识别出了几个肺癌潜在治疗靶点,为开发新型治疗策略提供了关键见解.
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