不同时期白花前胡内生菌的多样性和差异性

Diversity and Difference of Endophytes in Peucedanum praeruptorum Dunn at Different Stages

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摘要目的:探索抽薹前、抽薹后及开花期白花前胡内生菌的多样性与差异性.方法:采用宏基因组学的方法对白花前胡抽薹前、抽薹后及开花期3组35份样品内生细菌及真菌的菌群进行分析.结果:从白花前胡中鉴定出2624个细菌OTUs,抽薹前、抽薹后及开花期共有OTUs为115个;鉴定出4281个真菌OTUs,抽薹前、抽薹后及开花期共有OTUs为312个.开花期的内生细菌多样性指数显著高于抽薹前,三组样品的内生真菌无显著差异.在属水平上,假单胞菌属(Pseudomonas)和伯克霍尔德菌(Burkholderia)为主要优势细菌属.前胡抽薹前、抽薹后的瓶霉属(Phialophora),小球腔菌属(Leptosphaeria)丰度显著高于开花期.聚类结果显示内生细菌为抽薹后,开花期聚为一类后再与抽薹前聚为一类,而内生真菌为抽薹前,抽薹后聚为一类后再与开花期聚为一类.LEfSe分析发现前胡抽薹前,抽薹后及开花期内生细菌共有32个差异丰富的分类学分支,内生真菌有29个差异丰富的分类学分支(a=0.01,LDA Score≥2.0).结论:丰富了白花前胡内生细菌和内生真菌的种类与资源.