换一批积雪草CabHLH基因家族的全基因组鉴定和表达分析
Whole Genome Identification and Gene Expression Analysis of CabHLH Gene Family in Centella asiatica
摘要目的:鉴定积雪草中bHLH转录因子家族,利用生信分析其蛋白理化性质和在基因组中的相关特性,为CabHLH家族基因在积雪草三萜生物合成调控研究中提供理论基础.方法:根据bHLH基因家族特征筛选积雪草的CabHLH基因家族,进行生信学分析和表达分析.结果:基于基因组和转录组一共鉴定得到137个CabHLHs基因,命名为CabHLH001～CabHLH137.每个CabHLH蛋白均有bHLH结构域,多数为亲水性蛋白,定位于细胞核,系统进化树分析发现CabHLH家族蛋白成员可被分为16个组别29个亚组,与拟南芥AtbHLH蛋白系统分类结果类似.积雪草CabHLHs在基因组内存在大量的基因复制,而与拟南芥的共线性发现成对基因较少,这些成对的基因具有类似的生物学功能.137个CabHLHs在不同组织部位呈现差异表达,CabHLH017、CabHLH023、CabHLH096、CabHLH076表达受到茉莉酸甲酯(MeJA)诱导并在叶中高表达.结论:在积雪草基因组中共获得137个CabHLHs基因,具有亚家族分类的序列特征和不同的表达模式,叶中高表达并响应MeJA的CabHLHs可能具有调控积雪草三萜生物合成的作用.
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关键词
积雪草bHLH基因家族全基因组鉴定进化分析Centella asiaticabHLH gene familyGenome-wide identificationSystem evolution
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1006-9690.2024.10.004
发布时间
2024-11-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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