基于高通量转录组测序的崖柏两型叶发育研究
Study on the Development of Dimorphic Leaves in Thuja sutchuenensis Based on High-throughput Transcriptome Sequencing
摘要目的:研究崖柏2种叶型发育的分子机制,挖掘导致差异形成的关键基因.方法:以针叶和鳞叶为材料进行高通量转录组测序,筛选与叶型发育相关的基因并进行RT-qPCR验证.结果:转录组测序后,将Unigene比对到NR、Swiss-Prot、Pfam、eggNOG、GO、KEGG等数据库进行注释,共获得31 892个Unigene注释信息.差异表达基因共4 744个,其中有3 413个基因上调表达,1 331个基因下调表达.差异基因主要参与植物病原体互作、植物激素信号转导、MAPK信号等代谢通路.对其中6个差异基因进行RT-qPCR分析,结果显示,6个基因的表达量变化趋势与转录组测序结果基本一致.结论:通过对崖柏2种叶型转录组测序,初步揭示了崖柏叶片发育调控的候选基因,为柏科植物两型叶发育研究提供科学依据.
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