换一批
换一批基于生物信息学探讨三七对脑缺血再灌注损伤大鼠基因表达的影响
Effects of Panax notoginseng on gene expressions in rats with cerebral ischemia-reperfusion injury based on bioinformatics
摘要目的 基于生物信息学预测三七(Panax notoginseng)抗脑缺血再灌注损伤(cerebral ischemia reperfusion injury,CIRI)可能作用靶点及其信号通路.方法 通过 GEO 数据库,获取包含大脑中动脉阻塞(middle cerebral artery occlusion,MCAO)大鼠模型组(简称"MCAO大鼠模型组")、三七实验组大脑皮层的基因检测结果,筛选关键差异基因,然后进行GO 富集与 KEGG 通路分析,探讨三七抗脑缺血再灌注损伤可能的分子机制.结果 筛选出 444个差异 mRNA,关键差异基因为Fn1、Gsk3b、Snap25等;通过KEGG富集通路分析得到20 条显著通路,结合脑缺血再灌注损伤机制与相关文献检索报道,关键通路为Rap1信号通路、cAMP信号通路、自噬信号通路、AMPK信号通路等,其中在MCAO大鼠模型中,三七与自噬通路的相关研究尚少;也尚未查到三七单药关于Gsk3b、Snap25靶点的研究.结论 在脑缺血再灌注损伤中,三七可能从抗炎、抗氧化、抗凋亡、自噬等方面发挥一定的保护作用,为三七深入研究奠定了基础.
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