换一批基于多组学数据的孟德尔随机化分析鉴定椎间盘退变可成药靶点及中药预测
Identification of Druggable Targets for Intervertebral Disc Degeneration Based on Multi-Omics Data-Driven Mendelian Randomization and Prediction of Traditional Chinese Medicine Interventions
摘要目的 研究治疗椎间盘退变的可成药靶点并评估其安全性,预测调控可成药靶点治疗椎间盘退变的中药.方法 从eQTLGen Consortium获取可成药基因的表达数量性状位点作为暴露,GWAS Catalog数据库获取椎间盘退变的全基因组关联研究数据作为结局进行药物靶点孟德尔随机化(Mendelian Randomization,MR)分析,寻找椎间盘退变潜在的治疗靶点.对椎间盘退变可成药基因进行GO、KEGG富集分析.从FinnGen数据库获取椎间盘退变可成药基因的蛋白数量性状位点,作为暴露进行MR验证上述可成药基因的有效性.通过PheWAS Portal进行全表型组关联研究,评估药物安全性;利用BATMAN-TCM 2.0及ETCM 2.0平台挖掘中药成分,分析用药规律.通过CB-Dock 2平台对靶点及中药成分进行分子对接,寻找潜在的先导化合物.结果 延胡索、巴戟天、艾叶等35味中药中的20个有效成分可通过调控ZP3、RRM2B、CCL4等3个可成药靶点治疗椎间盘退变;基因表达MR提示248个可成药基因与椎间盘退变存在因果关系,富集分析显示上述基因与细胞因子活性、细胞衰老等过程相关,蛋白MR验证其中6个基因为椎间盘退变的可成药靶点;全表型组关联研究未发现上述可成药靶点存在明显不良反应;分子对接显示上述中药成分与可成药靶点的结合活性较好,最佳结合能-10.2 kcal·mol-1.结论 ZP3、RRM2B、CCL4等基因是椎间盘退变的潜在药靶,安全性较好;延胡索、巴戟天、艾叶等中药通过可成药靶点治疗椎间盘退变,其有效成分如黄嘌呤核苷等是新药研发的潜在化合物.
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关键词
椎间盘退变孟德尔随机化药物靶点全表型组关联研究安全性中药预测Intervertebral Disc DegenerationMendelian RandomizationDrug TargetsPhenome-Wide Association StudySafetyTraditional Chinese Medicine Prediction
分类号
R932（生药学《天然药物学》）
栏目名称
DOI
10.19803/j.1672-8629.20240899
发布时间
2025-05-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（82174415）
国家自然科学基金（82405441）
中国中医科学院创新工程重大攻关项目（C12021A05054）
中国中医科学院望京医院高水平医院建设循证研究重点专项（WJYY-XZKT-2023-25）
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