换一批苍术、黄柏在类风湿关节炎中的治疗机制:网络药理学与GEO数据的综合分析
Elucidating the therapeutic mechanism of Cang Zhu and Huang Bai in rheumatoid arthritis:a comprehensive analysis integrating network pharmacology and GEO data
摘要本研究通过应用网络药理学方法探讨苍术、黄柏治疗类风湿性关节炎的作用及其可能的机制.首先,从TCMSP数据库中获得药物的化学成分,通过SwissTargetPrediction数据库预测药物有效成分对应的靶点,再利用Cytoscape(v 3.8.0)构建药物-成分-靶点网络,根据网络的度值确定药物的主要活性成分.其次,通过GEO数据分析结合GeneCards、TTD和PharmGkb数据库的检索,获取与RA相关的靶标.再将药物靶点与RA相关靶标取交集,并利用R(v 4.2.2)对交集基因进行GO和KEGG富集分析.同时,通过String平台构建交集靶点的蛋白互作(PPI)网络,并利用Cytoscape(v 3.8.0)对药物-成分-靶点-疾病拓扑网络进行可视化,Cytohubba插件识别hub基因.发现苍术、黄柏的35种有效成分及其对应的673个靶点,其中包含14种主要活性成分.此外,获得784个与RA相关的靶点.再将药物与疾病相关的靶点取交集后,发现药物的34种有效成分可以作用于RA相关的126个靶点.通过对药物-成分-疾病-靶点拓扑网络进行分析,确定了5个hub基因.利用分子对接,确定这些hub基因与药物的14种主要活性成分的结合亲和力.交集基因的富集分析结果也表明,苍术、黄柏可以通过多成分、多靶点、多途径发挥抗RA作用.
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关键词
网络药理学GEO类风湿性关节炎苍术黄柏分子对接Network pharmacologyGEORheumatoid arthritisCang ZhuHuang BaiMolecular docking
分类号
R284（中药学）
栏目名称
DOI
10.5246/jcps.2024.10.068
发布时间
2024-12-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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