换一批
换一批基因表达连续分析标签数据库的实时定量多聚酶链反应验证
Validation of the Libraries of the Serial Analysis of Gene Expression by the Application of Real-time Quantitative Polymerase Chain Reaction
摘要目的 采用实时定量多聚酶链反应(PCR)技术验证不同丰度和匹配度的基因表达序列标签,尝试用该技术补充和完善高通量基因表达谱的结果.方法 根据各基因序列全长设计引物,选择9个单匹配标签,6个多匹配标签,1个美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库更新后无匹配标签和2个无匹配基因进行实时定量PCR验证.结果 挑选的所有基因均得到特异性扩增.基因表达量分析结果显示,基因表达连续分析(SAGE)文库中9个单匹配标签表达趋势和定量结果一致,且具有显著性差别;6个多匹配标签中有3个标签表达趋势和定量结果一致,且具有显著性差别;1个NCBI数据库更新后无匹配标签表达趋势和定量结果相反;2个无匹配基因表达量数据提示两组间没有显著性差别.结论 实时定量PCR技术是验证SAGE等高通量数据的可靠工具之一.SAGE文库标签匹配度可影响数据的可信度.
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