换一批常见伤口感染细菌高场不对称波形离子迁移谱识别算法
Algorithmic identification for high-field asymmetric ion mobility spectra of common wound-infecting bacteria
摘要目的:使用模式识别算法对常见伤口感染细菌(大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌)TH肉汤培养液及纯TH培养液的高场不对称波形离子迁移谱(FAIMS图谱)进行分类识别.方法:使用FAIMS分析仪收集了4种样品的训练及测试样本.预处理后,用主成分分析和线性判别分析对样本进行降维和特征提取,得到了训练集和测试集的空间三维分布模型,再用最近邻规则算法进行样本识别.结果:特征提取后,正负模式样本均具有良好的分离效果,并且正模式可分性明显优于负模式.当K取合适的值时,正负模式识别率分别可达90％和70％以上.对于本文的数据模型,K取值等于或最接近每类样本数的奇数为最佳.结论:该种算法可用于常见伤口感染细菌肉汤培养液FAIMS图谱的分类及识别.
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关键词
[关键字]高场不对称波形离子迁移谱常见伤口感染细菌模式识别算法high-field asymmetric ion mobility spectracommon wound-infecting bacteriapattern recognition algorithm
分类号
TN911.73
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1005-202X.2018.02.017
发布时间
2018-03-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家国际科技合作专项（(2014DFA31560)）
重庆市科技研发基地建设计划（(cstc2013gjhz10003)）
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