换一批摘要提出一种综合考虑通路局部和全局信息的基因通路富集分析(GIGSEA)方法.首先利用基因相互作用数据,通过基因在通路的局部重要性和在通路数据库的全局特异性计算基因的影响力;然后将基因影响力和表型相关性值融合在一起,计算通路的富集分数;最后通过置换基因富集出统计学显著的通路.将GIGSEA方法运用于肝细胞癌和结肠直肠癌数据集进行风险通路富集,与基因集富集分析方法相比,GIGSEA方法能富集出一些新的相关通路,并排除无关的通路,提高疾病相关通路的富集效果.
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分类号
R318（医用一般科学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1005-202X.2022.09.019
发布时间
2022-10-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
广东省重点领域研发计划（2021B0202070001）
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