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基于数字PCR平台的肺炎支原体耐药突变检测试剂盒与tNGS在肺炎支原体常见耐药突变检测中的效能对比

A comparative study on the efficacy of detection kit based on digital PCR for drug-resistant mutations of mycoplasma pneumonia and tNGS method in detection for common resistance mutation of mycoplasma pneumonia

摘要目的:基于MicroDrop微滴式数字聚合酶链式反应(PCR)平台的肺炎支原体鉴定及常见耐药突变检测试剂盒与高通量测序的病原靶向测序(tNGS)方法在肺炎支原体常见耐药突变检测的效能对比研究.方法:收集2023至2024年广东省人民医院肺炎住院患者的300份临床呼吸道样本,采用肺炎支原体耐药突变检测试剂盒和tNGS方法对耐药突变基因进行检测,对结果不一致的样本用Sanger测序法进行验证.结果:300份肺炎支原体阳性样本经肺炎支原体耐药突变检测试剂盒和tNGS方法平行检测的检出率分别为87.00%和78.67%,检测结果较为一致(Kappa=0.711);在25份结果不一致的样本中,采用Sanger测序法进行验证,结果显示低频基因突变的样本中,试剂盒仍保持可靠的检出能力,然而tNGS方法存在漏检,因此试剂检测低频突变能力更优.结论:基于数字PCR的肺炎支原体耐药突变检测试剂盒在检测低频突变样本的检出率高于tNGS方法,该方法有助于提高检测结果的准确性,为临床诊治提供快速精准的耐药基因检测手段.

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